学科门类协调发展。现设有4个学系（基础医学与医学技术系、临床医学系、中西医结合学系、药学系）和1个独立研究院（转化医学研究院）。拥有本科专业6个，即临床医学、临床医学（儿科学）、临床医学（妇产科学）、中西医临床医学、药学、医学检验技术等专业，学制5年或4年。可招收来华留学生医学本科专业2个（临床医学、药学）。临床医学专业通过教育部专业认证，入选国家首批一流专业建设点和江苏高校品牌专业建设工程。拥有国家级精品课程1门、省级精品课程8门、省级在线开放课程2门、省级基础医学实验教学示范中心1个、省级临床医学学科综合训练中心1个、省级虚拟仿真教学项目1个。现有全日制在校本科生2478人，海外留学生404人，博硕士研究生635人。拥有一级学科博士学位授权点1个（临床医学），博士专业学位类别1个（临床医学），一级学科硕士学位授权点6个（基础医学、临床医学、中西医结合、公共卫生与预防医学、药学、中药学）以及硕士专业学位类别3个（临床医学、中医学、中药学），博士后流动站2个（中西医结合、临床医学）。拥有省级一级学科重点学科1个（中西医结合）、校级一级学科重点学科3个（基础医学、临床医学、中药学）、省级临床重点专科30个、省级研究生工作站12个。[1]

师资队伍结构持续优化。现有教职员工176人，其中专任教师132人，教授24人，副教授45人，具有博士学位105人，占专任教师的79.55%。45岁以下专任教师66人，其中具有博士学位者65人，占98.48%。具有外校学缘背景教师110人，占82%。拥有教育部新世纪优秀人才、江苏特聘教授、省“双创计划”、“333工程”、“青蓝工程”、“六大人才高峰”、“科教兴卫工程”等一批国家级/省级高层次人才。拥有教育部临床医学类专业教学指导委员会委员、省医药类研究生教育指导委员会委员等国家级/省级学术机构兼职20余人。[1]

科研水平与创新能力持续提升。临床医学学科进入ESI全球排名前1%行列，标志着临床医学学科建设和关键研究领域具有一定的国际学术水平和影响力。拥有国家中医药管理局重点研究室1个、省级重点实验室2个、省级科技创新团队2个、中央财政支持地方高校发展专项资金建设项目1个、校级科研机构8个、与扬州市共建科研机构1个。近年来承担国家重点研发计划、国家自然科学基金等省部级以上课题300余项，取得了一大批高水平的科研成果，产生了重要的社会和经济效益。

对外交流及合作持续加强。学院与美国、日本、韩国、马来西亚、新加坡等国家的医学教育、医疗卫生和科研机构建立了双边合作、学术交流关系，不断推进师生国际化进程。举办苏丹卡萨拉大学医学生国际交流项目、中国-苏丹医学教学研讨及现代临床技能培训等多个国际短期项目。设有《实用临床医药杂志》编辑部，该杂志为全国公开发行的核心期刊，曾获全国科技期刊评比一等奖，连续五届获教育部“中国高校优秀期刊奖”。现为中国高校科技期刊研究会医学期刊专业委员会第二届常务委员会主任委员单位。拥有扬州大学附属医院（扬州市第一人民医院）、扬州大学临床医学院（江苏省苏北人民医院）、扬州大学临床中医学院（扬州市中医院）等8所临床学院，以及遍布省内外40余所教学实习医院、4个药业集团、1个药品检验所为实践教学基地。
      北京银通先达信息技术有限公司与校方在2019年11月19日签订科研管理系统项目合同，系统将于3个月后成功上线。