系统目前包含几十个模块，典型的有：科研门户网站、系统首页、科研办公、纵向项目、横向项目、内部项目、科研经费、成果管理、学术交流、获奖管理、设备管理、人才培养、外事管理、学协会管理、专家库管理、科研平台、机构人员管理、统计查询管理、信息发布、知识库管理、项目文档中心、系统管理、岗位考核、二次开发功能等，每个模块都有涉及到相应的子模块。